亲自处置了多起重大环境污染突发事件，如2007年8月，黔南州福泉市宏福公司因溃坝造成清水江支流水体严重磷污染，接到应急监测任务后，她认真分析污染源情况，制定监测方案，确定24小时连续监测，每10分钟采样一次;2007年12月，接到都柳江严重砷污染应急任务，全站再次紧急出动，赶赴现场，及时查清污染源，为及时治理提供科学数据，使砷污染得到了有效控制;2009年3月，都柳江发生锑污染影响到两个省区，省内其它监测站无锑标准物质，无法对污染物进行分析，监测任务全部落到州监测站头上，孙建琴同志亲临现场，勘察地形确定监测方案 ，24小时连续监测分析，连续3个月查清污染源，再次圆满完成了应急任务;2012年3月21日凌晨2点左右，接到州应急办通知，凯里市饮用水源地上游运输农药车辆翻车泄露，泄露农药进入了饮用水源地排洪沟内，全市饮用水告急，为了及时排除隐患，她连续两天不眠不休，实地踏勘，制定处置方案，及时处理了污染事故，并得到了省领导好评。

　　除了做好本职工作外，还时时处处想着为环保公益事业多流一滴汗、出一份力。2010年加入呵护地球环保志愿者协会，应邀担任名誉理事长一职，指导协会开展了一系列有影响的环保公益活动。